مجلس الاتحاد :
وهو السلطة العليا والمسئول عن اعتماد السياسة العامة للاتحاد وتخطيط برامجه ومتابعة نشاطه وإقرار ميزانيته . ويتمتع المجلس بكافة الصلاحيات اللازمة لتحقيق أهداف الاتحاد ، ويتألف من رؤساء الأجهزة الأعضاء في الاتحاد أو من ينوب عنهم ويعقد المجلس اجتماعات دورته العادية مرة كل سنة ، في المكان الذي يحدده اجتماعه السابق ، ويتم افتتاحها يوم الثلاثاء من الأسبوع الثاني من شهر كانون الأول / ديسمبر . وقد يجتمع المجلس ، عند الضرورة في دورة استثنائية وفق ما جاء في النظام الداخلي للمجلس .
أما رئاسة مجلس الاتحاد فيتناوب عليها أعضاءه حسب الترتيب الهجائي لأسماء الأقطار العربية المعمول به في جامعة الدول العربية ويتولى رئاسة الدورة الاستثنائية ، في حالة انعقادها ، رئيس الدورة العادية .
صلاحيات المجلس
- إصدار التوصيات والقرارات اللازمة لتحقيق أهداف الاتحاد .
- إقرار الأنظمة اللازمة لعمل الاتحاد .
- تعديل النظام الأساسي للاتحاد .
- انتخاب وتعيين الأمين العام .
- إقرار المشروعات والبرامج .
- قبول أعضاء مشاركين .
- إقرار الموازنات والتصديق على الحسابات الختامية .
- إقرار وسائل استثمار أموال الاتحاد وعقد القروض والاتفاقيات .
- إقرار أسس قبول المنح والإعانات والهبات .
- إقرار أسس تنظيم أوجه نشاط الاتحاد والموارد الناشئة عنه .
- تشكيل اللجان الفنية الدائمة وتحديد اختصاصاتها .
- تحديد مكان انعقاد المجلس في دورته التالية .
- تخويل بعض صلاحياته للامين العام .
